In 1999 ging Mojtaba naar Qom, een heilige stad die wordt beschouwd als een belangrijk centrum van de sjiitische theologie, om zijn religieuze studies voort te zetten. Het is opmerkelijk dat hij tot die tijd geen administratieve kleding droeg, en het is onduidelijk waarom hij op 30-jarige leeftijd besloot een seminarie te bezoeken, aangezien dit gebruikelijker is in iemands jongere jaren.
